Após o desaparecimento de Mulder, Scully retorna à sede do FBI para encontrar o agente especial John Doggett liderando uma caçada humana do FBI por seu parceiro. Sabendo que esse tipo de busca será inútil, Scully e Skinner recorrem aos Pistoleiros Solitários na esperança de descobrir informações sobre atividade adicional de OVNIs na época do desaparecimento de Mulder. Embora tais informações os levem a Gibson Praise, o homem com Gibson, um homem que parece ser Mulder, é na verdade um caçador de recompensas alienígena. Finalmente percebendo que Mulder não será encontrado tão facilmente, o agente Doggett é oficialmente designado para os Arquivos X. Agora, depois de tudo o que ela passou com Mulder, é Scully quem é “a crente” e que deve encontrar uma maneira de trabalhar com “o cético”, John Doggett.